玛丽医院自2003年7月起成为香港指定的肝脏移植中心，提供世界级水准的　　作为一间地区性急症全科医院，玛丽医院为市民提供全面的医护服务，包括24小时急症室服务，各项专科和分科、以至复康服务。玛丽医院作为第三层和第四层的医疗服务转介中心，须负责诊治需要复杂及高科技医疗服务的病人，包括器官移植、初生婴儿深切治疗服务、儿童外科、辅助生育、心脏护理、口腔颔面外科及牙科、烧伤及整形外科与及脑外科等。肝脏移植服务。玛丽医院也提供一些独有的专科服务，例如骨髓移植；并与学术机构及医药/医疗仪器公司合作进行临床研究。

玛丽医院提供多方面的日间医疗护理，如癌病化疗、痛症治疗、体外冲击波碎石、内窥镜检查及心脏胸肺科、血液及肿瘤科及内分泌特别检查。

在社区及复康服务方面，除了为癌症病人提供纾缓护理谘询服务，院方亦借出辅助仪器给后期癌症病人，好让他们在家中自我照顾时，能改善生活质素。此外，纾缓服务亦为住院癌症病人提供谘询及心理社交的照顾；及为出院病人定期覆诊及提供家居照顾。社康护理服务亦已进行重整工作。

节省能源、保护环境、职业健康及安全等项目，已透过研讨会、通讯、训练(人手处理化学物品安全问题、预防职业病及风险评估)、巡视、委任监察员及联络主任等途径进行。